ອາວຸດໃໝ່ສຳລັບການວິນິດໄສວັນນະໂລກ ແລະ ການກວດຫາການດື້ຢາ: ການຈັດລຳດັບເປົ້າໝາຍລຸ້ນໃໝ່ (tNGS) ລວມກັບການຮຽນຮູ້ຂອງເຄື່ອງຈັກສຳລັບການວິນິດໄສຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ວັນນະໂລກ
ບົດລາຍງານວັນນະຄະດີ: CCa: ຮູບແບບການວິນິດໄສໂດຍອີງໃສ່ tNGS ແລະ ການຮຽນຮູ້ຂອງເຄື່ອງຈັກ, ເຊິ່ງເໝາະສົມສຳລັບຜູ້ທີ່ມີວັນນະໂລກ ແລະ ເຍື່ອຫຸ້ມສະໝອງອັກເສບຈາກເຊື້ອແບັກທີເຣຍໜ້ອຍລົງ.
ຫົວຂໍ້ວິທະຍານິພົນ: ການຈັດລຽງລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປທີ່ແນໃສ່ວັນນະໂລກ ແລະ ການຮຽນຮູ້ຂອງເຄື່ອງຈັກ: ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງສໍາລັບທໍ່ປອດອັກເສບ ແລະ ເຍື່ອຫຸ້ມສະໝອງອັກເສບທໍ່.
ໄລຍະເວລາ: 《Clinica Chimica Acta》
ຖ້າ: 6.5
ວັນທີພິມເຜີຍແຜ່: ມັງກອນ 2024
ໂດຍສົມທົບກັບມະຫາວິທະຍາໄລສະພາວິທະຍາສາດຈີນ ແລະ ໂຮງໝໍໜ້າເອິກປັກກິ່ງຂອງມະຫາວິທະຍາໄລແພດສາດນະຄອນຫຼວງ, Macro & Micro-Test ໄດ້ສ້າງຮູບແບບການວິນິດໄສວັນນະໂລກໂດຍອີງໃສ່ເຕັກໂນໂລຊີການຈັດລຳດັບເປົ້າໝາຍ (tNGS) ລຸ້ນໃໝ່ ແລະ ວິທີການຮຽນຮູ້ຂອງເຄື່ອງຈັກ, ເຊິ່ງໃຫ້ຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ການກວດພົບວັນນະໂລກທີ່ມີເຊື້ອແບັກທີເຣຍໜ້ອຍ ແລະ ເຍື່ອຫຸ້ມສະໝອງອັກເສບຈາກວັນນະໂລກ, ໃຫ້ວິທີການວິນິດໄສຄວາມອ່ອນໄຫວແບບໃໝ່ສຳລັບການວິນິດໄສທາງຄລີນິກຂອງວັນນະໂລກສອງຊະນິດ, ແລະ ຊ່ວຍໃນການວິນິດໄສທີ່ຖືກຕ້ອງ, ການກວດຫາການດື້ຢາ ແລະ ການປິ່ນປົວວັນນະໂລກ. ໃນເວລາດຽວກັນ, ພົບວ່າ cfDNA ໃນ plasma ຂອງຄົນເຈັບສາມາດໃຊ້ເປັນຕົວຢ່າງທີ່ເໝາະສົມສຳລັບການເກັບຕົວຢ່າງທາງຄລີນິກໃນການວິນິດໄສ TBM.
ໃນການສຶກສາຄັ້ງນີ້, ຕົວຢ່າງ plasma ແລະ ຕົວຢ່າງນ້ຳໃນສະໝອງ 227 ຕົວຢ່າງໄດ້ຖືກນຳໃຊ້ເພື່ອສ້າງກຸ່ມຄົນເຈັບທາງຄລີນິກສອງກຸ່ມ, ເຊິ່ງຕົວຢ່າງກຸ່ມຄົນເຈັບທາງຫ້ອງທົດລອງໄດ້ຖືກນຳໃຊ້ເພື່ອສ້າງຮູບແບບການຮຽນຮູ້ຂອງເຄື່ອງຈັກໃນການວິນິດໄສວັນນະໂລກ, ແລະ ຕົວຢ່າງກຸ່ມຄົນເຈັບທາງຄລີນິກໄດ້ຖືກນຳໃຊ້ເພື່ອກວດສອບຮູບແບບການວິນິດໄສທີ່ໄດ້ສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນແລ້ວ. ຕົວຢ່າງທັງໝົດແມ່ນເປົ້າໝາຍທຳອິດໂດຍກຸ່ມກວດຈັບເປົ້າໝາຍທີ່ອອກແບບມາເປັນພິເສດສຳລັບ Mycobacterium tuberculosis. ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ອີງຕາມຂໍ້ມູນການຈັດລຳດັບ TB-tNGS, ຮູບແບບຕົ້ນໄມ້ການຕັດສິນໃຈຖືກນຳໃຊ້ເພື່ອປະຕິບັດການກວດສອບຄວາມຖືກຕ້ອງ 5 ເທົ່າໃນຊຸດການຝຶກອົບຮົມ ແລະ ການກວດສອບຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຄິວການວິນິດໄສໃນຫ້ອງທົດລອງ, ແລະ ໄດ້ຮັບຂອບເຂດການວິນິດໄສຂອງຕົວຢ່າງ plasma ແລະ ຕົວຢ່າງນ້ຳໃນສະໝອງ. ຂອບເຂດທີ່ໄດ້ຮັບແມ່ນນຳມາເປັນສອງຊຸດການທົດສອບຂອງຄິວການວິນິດໄສທາງຄລີນິກເພື່ອກວດຫາ, ແລະ ປະສິດທິພາບການວິນິດໄສຂອງຜູ້ຮຽນໄດ້ຖືກປະເມີນໂດຍເສັ້ນໂຄ້ງ ROC. ສຸດທ້າຍ, ຮູບແບບການວິນິດໄສວັນນະໂລກໄດ້ຮັບ.
ຮູບທີ 1 ແຜນວາດແບບແຜນຂອງການອອກແບບການຄົ້ນຄວ້າ
ຜົນໄດ້ຮັບ: ອີງຕາມຂອບເຂດສະເພາະຂອງຕົວຢ່າງ DNA ໃນນ້ຳไขสันหลัง (AUC = 0.974) ແລະ ຕົວຢ່າງ cfDNA ໃນ plasma (AUC = 0.908) ທີ່ກຳນົດໄວ້ໃນການສຶກສາຄັ້ງນີ້, ໃນບັນດາຕົວຢ່າງ 227 ຕົວຢ່າງ, ຄວາມອ່ອນໄຫວຂອງຕົວຢ່າງນ້ຳไขสันหลังແມ່ນ 97.01%, ຄວາມຈຳເພາະແມ່ນ 95.65%, ແລະຄວາມອ່ອນໄຫວ ແລະ ຄວາມຈຳເພາະຂອງຕົວຢ່າງ plasma ແມ່ນ 82.61% ແລະ 86.36%. ໃນການວິເຄາະຕົວຢ່າງ cfDNA ໃນ plasma ແລະ DNA ນ້ຳไขสันหลัง 44 ຄູ່ຈາກຄົນເຈັບທີ່ເປັນໂຣກ TBM, ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສຂອງການສຶກສານີ້ມີຄວາມສອດຄ່ອງສູງເຖິງ 90.91% (40/44) ໃນ cfDNA ໃນ plasma ແລະ DNA ນ້ຳไขสันหลัง, ແລະຄວາມອ່ອນໄຫວແມ່ນ 95.45% (42/44). ໃນເດັກທີ່ເປັນວັນນະໂລກປອດ, ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສຂອງການສຶກສານີ້ມີຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ຕົວຢ່າງ plasma ຫຼາຍກວ່າຜົນການກວດຫາ Xpert ຂອງຕົວຢ່າງນ້ຳກະເພາະອາຫານຈາກຄົນເຈັບດຽວກັນ (28.57% VS 15.38%).
ຮູບທີ 2 ປະສິດທິພາບການວິເຄາະຂອງຮູບແບບການວິນິດໄສວັນນະໂລກສຳລັບຕົວຢ່າງປະຊາກອນ
ຮູບທີ 3 ຜົນການວິນິດໄສຂອງຕົວຢ່າງທີ່ຈັບຄູ່
ສະຫຼຸບ: ວິທີການວິນິດໄສພະຍາດວັນນະໂລກທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງໄດ້ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໃນການສຶກສານີ້, ເຊິ່ງສາມາດສະໜອງເຄື່ອງມືການວິນິດໄສທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງສຸດໃນການກວດຫາຄົນເຈັບທາງຄລີນິກທີ່ມີພະຍາດວັນນະໂລກຊະນິດໜຶ່ງ (ການກວດເຊື້ອທາງລົບ). ການກວດຫາພະຍາດວັນນະໂລກທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງໂດຍອີງໃສ່ plasma cfDNA ອາດເປັນຕົວຢ່າງທີ່ເໝາະສົມສຳລັບການວິນິດໄສພະຍາດວັນນະໂລກທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວ ແລະ ເຍື່ອຫຸ້ມສະໝອງອັກເສບຈາກວັນນະໂລກ (ຕົວຢ່າງ plasma ແມ່ນເກັບໄດ້ງ່າຍກວ່ານ້ຳไขสันหลังສຳລັບຄົນເຈັບທີ່ສົງໃສວ່າເປັນວັນນະໂລກໃນສະໝອງ).
ລິ້ງຕົ້ນສະບັບ: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
ແນະນຳໂດຍຫຍໍ້ກ່ຽວກັບຜະລິດຕະພັນກວດຫາວັນນະໂລກຊຸດ Macro & Micro-Test
ເນື່ອງຈາກສະຖານະການຕົວຢ່າງທີ່ສັບສົນຂອງຄົນເຈັບວັນນະໂລກ ແລະ ຄວາມຕ້ອງການທີ່ຫຼາກຫຼາຍ, Macro & Micro-Test ໃຫ້ບໍລິການຊຸດວິທີແກ້ໄຂ NGS ທີ່ສົມບູນສຳລັບການສະກັດເອົານໍ້າຈາກຕົວຢ່າງຂີ້ກະເທີ່, ການສ້າງ ແລະ ການຈັດລໍາດັບຫ້ອງສະໝຸດ Qualcomm, ແລະ ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ. ຜະລິດຕະພັນດັ່ງກ່າວກວມເອົາການວິນິດໄສໄວຂອງຄົນເຈັບວັນນະໂລກ, ການກວດຫາການດື້ຢາຂອງວັນນະໂລກ, ການຈັດປະເພດຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣຍວັນນະໂລກ ແລະ NTM, ການວິນິດໄສຄວາມແພ້ຂອງວັນນະໂລກທີ່ບໍ່ມີເຊື້ອແບັກທີເຣຍ ແລະ ຄົນທີ່ເປັນວັນນະໂລກ, ແລະອື່ນໆ.
ຊຸດກວດຫາເຊື້ອວັນນະໂລກ ແລະ ເຊື້ອໄມໂຄແບັກທີເຣຍຕາມລຳດັບ:
| ເລກທີລາຍການ | ຊື່ຜະລິດຕະພັນ | ເນື້ອໃນການທົດສອບຜະລິດຕະພັນ | ປະເພດຕົວຢ່າງ | ຮູບແບບທີ່ນຳໃຊ້ໄດ້ |
| HWTS-3012 | ຕົວແທນປ່ອຍຕົວຢ່າງ | ໃຊ້ໃນການປິ່ນປົວຕົວຢ່າງ sputum ທີ່ເປັນຂອງແຫຼວ, ໄດ້ຮັບເລກບັນທຶກຊັ້ນໜຶ່ງ, Sutong Machinery Equipment 20230047. | ນໍ້າເມືອກ | |
| HWTS-NGS-P00021 | ຊຸດກວດຈັບປະລິມານ Qualcomm ສຳລັບວັນນະໂລກທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງ (ວິທີການຈັບແບບ probe) | ການກວດຫາຄວາມແພ້ທີ່ບໍ່ແມ່ນການຜ່າຕັດ (ການກວດເອົາເນື້ອເຍື່ອແຫຼວ) ສຳລັບວັນນະໂລກປອດ ແລະ ຕຸ່ມໃນສະໝອງທີ່ບໍ່ມີເຊື້ອແບັກທີເຣຍລົບ; ຕົວຢ່າງຂອງຜູ້ທີ່ສົງໃສວ່າຕິດເຊື້ອວັນນະໂລກ ຫຼື ເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ບໍ່ແມ່ນວັນນະໂລກໄດ້ຖືກວິເຄາະໂດຍການວິເຄາະ metagenomics ຂອງການຈັດລຳດັບຄວາມເລິກສູງ, ແລະຂໍ້ມູນການກວດຫາວ່າມີເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ເປັນວັນນະໂລກ ຫຼື ເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ບໍ່ແມ່ນວັນນະໂລກໄດ້ຕິດເຊື້ອ ແລະ ຂໍ້ມູນການດື້ຢາຫຼັກຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ເປັນວັນນະໂລກໄດ້ຖືກສະໜອງໃຫ້. | ເລືອດສ່ວນນອກ, ນ້ຳລ້າງຖົງລົມ, ນ້ຳໃນຊ່ອງທ້ອງ ແລະ ນ້ຳໃນທ້ອງ, ຕົວຢ່າງການເຈາະຮູໂຟກັດ, ນ້ຳໃນສະໝອງ. | ລຸ້ນທີສອງ |
| HWTS-NGS-T001 | ຊຸດກວດຈັບການຈັດປະເພດ ແລະ ການດື້ຢາຂອງເຊື້ອ Mycobacterium (ວິທີການຈັດລຳດັບການຂະຫຍາຍຫຼາຍຈຸດ) | ການທົດສອບການຈັດປະເພດ Mycobacterium, ລວມທັງ MTBC ແລະ 187 NTM;ການກວດພົບການດື້ຢາຂອງເຊື້ອ Mycobacterium tuberculosis ກວມເອົາຢາ 13 ຊະນິດ ແລະ 16 ສະຖານທີ່ກາຍພັນຫຼັກຂອງເຊື້ອພັນທຸກຳດື້ຢາ. | ນໍ້າມູກ, ນໍ້າລ້າງຖົງລົມ, ນໍ້າໃນຊ່ອງເອິກ ແລະ ນໍ້າໃນທ້ອງ, ຕົວຢ່າງການເຈາະຮູໂຟກັດ, ນໍ້າໃນສະໝອງ. | ແພລດຟອມຄູ່ລຸ້ນທີສອງ/ທີສາມ |
ຈຸດເດັ່ນ: ຊຸດກວດຈັບການຈຳແນກເຊື້ອ Mycobacterium ແລະ ການດື້ຢາ HWTS-NGS-T001 (ວິທີການຂະຫຍາຍສັນຍານຫຼາຍຈຸດ)
ການແນະນຳຜະລິດຕະພັນ
ຜະລິດຕະພັນດັ່ງກ່າວແມ່ນອີງໃສ່ຢາຫຼັກອັນດັບໜຶ່ງ ແລະ ອັນດັບສອງທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນຄຳແນະນຳການປິ່ນປົວວັນນະໂລກຂອງ WHO, ຢາ macrolides ແລະ aminoglycosides ທີ່ນິຍົມໃຊ້ໃນຄຳແນະນຳການປິ່ນປົວ NTM, ແລະ ຈຸດທີ່ຕ້ານທານຢາກວມເອົາກຸ່ມໜຶ່ງຂອງຈຸດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕ້ານທານຢາໃນລາຍການການກາຍພັນຂອງ Mycobacterium tuberculosis complex ຂອງ WHO, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບພັນທຸກໍາຕ້ານທານຢາ ແລະ ຈຸດທີ່ກາຍພັນອື່ນໆທີ່ລາຍງານຕາມການສືບສວນ ແລະ ສະຖິຕິຂອງເອກະສານທີ່ມີຄະແນນສູງທັງພາຍໃນ ແລະ ຕ່າງປະເທດ.
ການລະບຸຕົວອັກສອນພິມແມ່ນອີງໃສ່ສາຍພັນ NTM ທີ່ສະຫຼຸບໄວ້ໃນຄຳແນະນຳຂອງ NTM ທີ່ຈັດພິມໂດຍວາລະສານວັນນະໂລກ ແລະ ພະຍາດທາງເດີນຫາຍໃຈຈີນ ແລະ ການເຫັນດີເປັນເອກະພາບຂອງຜູ້ຊ່ຽວຊານ. ໄພຣເມີພິມທີ່ອອກແບບມາສາມາດຂະຫຍາຍ, ຈັດລຳດັບ ແລະ ໝາຍເຫດປະກອບຫຼາຍກວ່າ 190 ຊະນິດ NTM.
ຜ່ານເທັກໂນໂລຢີການຂະຫຍາຍ PCR ແບບ multiplex ເປົ້າໝາຍ, ພັນທຸກໍາ genotyping ແລະ ພັນທຸກໍາທີ່ດື້ຢາຂອງ Mycobacterium ໄດ້ຖືກຂະຫຍາຍໂດຍ multiplex PCR, ແລະ ໄດ້ຮັບການລວມ amplicon ຂອງພັນທຸກໍາເປົ້າໝາຍທີ່ຈະກວດພົບ. ຜະລິດຕະພັນທີ່ຂະຫຍາຍອອກສາມາດສ້າງເປັນຫ້ອງສະໝຸດລໍາດັບການຜະລິດສູງລຸ້ນທີສອງ ຫຼື ລຸ້ນທີສາມ, ແລະ ແພລດຟອມລໍາດັບລຸ້ນທີສອງ ແລະ ລຸ້ນທີສາມທັງໝົດສາມາດຖືກນໍາໄປໃຊ້ກັບລໍາດັບຄວາມເລິກສູງເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຂໍ້ມູນລໍາດັບຂອງພັນທຸກໍາເປົ້າໝາຍ. ໂດຍການປຽບທຽບກັບການກາຍພັນທີ່ຮູ້ຈັກທີ່ມີຢູ່ໃນຖານຂໍ້ມູນອ້າງອີງທີ່ຕິດຕັ້ງໄວ້ (ລວມທັງລາຍການການກາຍພັນທີ່ສັບສົນຂອງພະຍາດວັນນະໂລກ Mycobacterium tuberculosis ຂອງ WHO ແລະ ຄວາມສຳພັນຂອງມັນກັບການດື້ຢາ), ການກາຍພັນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການດື້ຢາ ຫຼື ຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ຢາຕ້ານວັນນະໂລກໄດ້ຖືກກໍານົດ. ລວມກັບວິທີແກ້ໄຂການປິ່ນປົວຕົວຢ່າງ sputum ທີ່ເປີດດ້ວຍຕົນເອງຂອງ Macro & Micro-Test, ບັນຫາຂອງປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍກົດ nucleic ຕໍ່າຂອງຕົວຢ່າງ sputum ທາງຄລີນິກ (ສູງກວ່າວິທີການແບບດັ້ງເດີມສິບເທົ່າ) ໄດ້ຖືກແກ້ໄຂ, ດັ່ງນັ້ນການກວດຫາລໍາດັບການດື້ຢາສາມາດນຳໃຊ້ໂດຍກົງກັບຕົວຢ່າງ sputum ທາງຄລີນິກ.
ຂອບເຂດການກວດຈັບຜະລິດຕະພັນ
34ພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕ້ານທານຢາ18ຢາຕ້ານວັນນະໂລກ ແລະ6ກວດພົບຢາເສບຕິດ NTM, ເຊິ່ງກວມເອົາ297ສະຖານທີ່ດື້ຢາ; Mycobacterium tuberculosis ສິບຊະນິດ ແລະ ຫຼາຍກວ່າ190ກວດພົບປະເພດຂອງ NTM.
ຕາຕະລາງທີ 1: ຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຢາ 18+6 ຊະນິດ +190+NTM
ຂໍ້ໄດ້ປຽບຂອງຜະລິດຕະພັນ
ມີການປັບຕົວທາງດ້ານຄລີນິກທີ່ເຂັ້ມແຂງ: ຕົວຢ່າງ sputum ສາມາດກວດພົບໄດ້ໂດຍກົງດ້ວຍຕົວແທນທີ່ເຮັດໃຫ້ liquefaction ດ້ວຍຕົນເອງໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ເຊື້ອ.
ການທົດລອງແມ່ນງ່າຍດາຍ: ຮອບທຳອິດຂອງການຂະຫຍາຍສຽງແມ່ນງ່າຍດາຍ, ແລະ ການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະໝຸດແມ່ນສຳເລັດພາຍໃນ 3 ຊົ່ວໂມງ, ເຊິ່ງຊ່ວຍປັບປຸງປະສິດທິພາບໃນການເຮັດວຽກ.
ການກວດຈັບປະເພດ ແລະ ການດື້ຢາຢ່າງຄົບຖ້ວນ: ກວມເອົາສະຖານທີ່ກວດຈັບປະເພດ ແລະ ການດື້ຢາຂອງ MTB ແລະ NTM, ເຊິ່ງເປັນຈຸດສຳຄັນທາງດ້ານຄລີນິກ, ການກວດຈັບປະເພດ ແລະ ການດື້ຢາທີ່ຖືກຕ້ອງ, ສະໜັບສະໜູນຊອບແວການວິເຄາະເອກະລາດ, ແລະ ການສ້າງລາຍງານການວິເຄາະດ້ວຍການຄລິກດຽວ.
ຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້: ຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງຜະລິດຕະພັນ, ປັບຕົວເຂົ້າກັບແພລດຟອມ ILM ແລະ MGI/ONT ຫຼັກ.
ລາຍລະອຽດຜະລິດຕະພັນ
| ລະຫັດຜະລິດຕະພັນ | ຊື່ຜະລິດຕະພັນ | ແພລດຟອມການກວດສອບ | ລາຍລະອຽດ |
| HWTS-NGS-T001 | ຊຸດກວດຈັບການຈັດປະເພດ ແລະ ການດື້ຢາຂອງເຊື້ອ Mycobacterium (ວິທີການຂະຫຍາຍຫຼາຍຈຸດ) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
ເວລາໂພສ: ມັງກອນ-23-2024