ອາວຸດໃໝ່ສຳລັບການວິນິດໄສວັນນະໂລກ ແລະ ການກວດຫາຄວາມຕ້ານທານຂອງຢາ: ການຈັດລຳດັບເປົ້າໝາຍທີ່ສ້າງຂຶ້ນໃໝ່ (tNGS) ສົມທົບກັບການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກສຳລັບການວິນິດໄສຄວາມອ່ອນໄຫວຂອງວັນນະໂລກ.
ບົດລາຍງານວັນນະຄະດີ: CCa: ຮູບແບບການວິນິດໄສໂດຍອີງໃສ່ tNGS ແລະການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກ, ເຊິ່ງເຫມາະສົມສໍາລັບຜູ້ທີ່ເປັນວັນນະໂລກທີ່ມີເຊື້ອແບັກທີເລຍຫນ້ອຍແລະເຍື່ອຫຸ້ມສະຫມອງອັກເສບ.
ຫົວບົດວິທະຍານິພົນ: ການຈັດລຽງລຳດັບຍຸກໃໝ່ທີ່ແນໃສ່ວັນນະໂລກ ແລະ ການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກ: ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສທີ່ລະອຽດອ່ອນທີ່ສຸດສຳລັບທໍ່ປອດ paucific ແລະເຍື່ອຫຸ້ມສະໝອງອັກເສບ tubular.
ໄລຍະເວລາ: 《Clinica Chimica Acta》
ຖ້າ: 6.5
ວັນທີພິມເຜີຍແຜ່: ມັງກອນ 2024
ສົມທົບກັບວິທະຍາໄລວິທະຍາສາດຈີນແລະໂຮງຫມໍປັກກິ່ງ Chest Hospital ຂອງວິທະຍາໄລການແພດນະຄອນຫຼວງ, Macro & Micro-Test ໄດ້ສ້າງຕັ້ງຮູບແບບການວິນິດໄສວັນນະໂລກໂດຍອີງໃສ່ການຜະລິດໃຫມ່ຂອງ sequencing ເປົ້າຫມາຍ (tNGS) ເຕັກໂນໂລຊີແລະວິທີການການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກ, ເຊິ່ງສະຫນອງ ultra-high. ຄວາມອ່ອນໄຫວຂອງການກວດຫາວັນນະໂລກທີ່ມີເຊື້ອແບັກທີເຣັຍຈໍານວນຫນ້ອຍແລະເຍື່ອຫຸ້ມສະຫມອງອັກເສບຂອງວັນນະໂລກ, ໄດ້ສະຫນອງວິທີການວິນິດໄສ hypersensitivity ໃຫມ່ສໍາລັບການວິນິດໄສທາງຄລີນິກຂອງສອງປະເພດຂອງວັນນະໂລກ, ແລະຊ່ວຍໃຫ້ການວິນິດໄສທີ່ຖືກຕ້ອງ, ການກວດສອບການຕໍ່ຕ້ານຢາແລະການປິ່ນປົວວັນນະໂລກ.ໃນເວລາດຽວກັນ, ມັນໄດ້ຖືກພົບເຫັນວ່າ plasma cfDNA ຂອງຄົນເຈັບສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເປັນປະເພດຕົວຢ່າງທີ່ເຫມາະສົມສໍາລັບການເກັບຕົວຢ່າງທາງດ້ານການຊ່ວຍໃນການວິນິດໄສຂອງ TBM.
ໃນການສຶກສານີ້, 227 ຕົວຢ່າງ plasma ແລະຕົວຢ່າງນ້ໍາ cerebrospinal ໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງສອງ cohort ທາງດ້ານການຊ່ວຍ, ໃນຫ້ອງທົດລອງຕົວຢ່າງ cohort ການວິນິດໄສໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງຕົວແບບການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກຂອງການວິນິດໄສວັນນະໂລກ, ແລະຕົວຢ່າງການວິນິດໄສທາງດ້ານການຊ່ວຍໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກວດສອບການສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນ. ຮູບແບບການວິນິດໄສ.ຕົວຢ່າງທັງໝົດໄດ້ຖືກຕັ້ງເປົ້າໝາຍໄວ້ເປັນຄັ້ງທຳອິດໂດຍສະນຸກເກີການຈັບຕົວທີ່ຖືກອອກແບບມາເປັນພິເສດສຳລັບວັນນະໂລກ Mycobacterium.ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ອີງຕາມຂໍ້ມູນການຈັດລໍາດັບ TB-tNGS, ຮູບແບບຕົ້ນໄມ້ການຕັດສິນໃຈແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອປະຕິບັດການກວດສອບ 5 ເທົ່າໃນຊຸດການຝຶກອົບຮົມແລະການກວດສອບຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງແຖວການວິນິດໄສຂອງຫ້ອງທົດລອງ, ແລະກໍານົດຂອບເຂດການວິນິດໄສຂອງຕົວຢ່າງ plasma ແລະຕົວຢ່າງນ້ໍາ cerebrospinal.ເກນທີ່ໄດ້ຮັບແມ່ນໄດ້ນໍາເອົາເຂົ້າໄປໃນສອງຊຸດການທົດສອບຂອງແຖວການວິນິດໄສທາງຄລີນິກເພື່ອກວດຫາ, ແລະການປະຕິບັດການວິນິດໄສຂອງຜູ້ຮຽນໄດ້ຖືກປະເມີນໂດຍເສັ້ນໂຄ້ງ ROC.ໃນທີ່ສຸດ, ຮູບແບບການວິນິດໄສຂອງວັນນະໂລກໄດ້ຮັບ.
Fig. 1 ແຜນວາດ schematic ຂອງການອອກແບບການຄົ້ນຄວ້າ
ຜົນໄດ້ຮັບ: ອີງຕາມການກໍານົດຂອບເຂດສະເພາະຂອງຕົວຢ່າງ CSF DNA (AUC = 0.974) ແລະ plasma cfDNA ຕົວຢ່າງ (AUC = 0.908) ທີ່ກໍານົດໃນການສຶກສານີ້, ໃນບັນດາ 227 ຕົວຢ່າງ, ຄວາມອ່ອນໄຫວຂອງຕົວຢ່າງ CSF ແມ່ນ 97,01%, ຄວາມສະເພາະແມ່ນ 95,65%, ແລະ. ຄວາມອ່ອນໄຫວແລະຄວາມສະເພາະຂອງຕົວຢ່າງ plasma ແມ່ນ 82.61% ແລະ 86.36%.ໃນການວິເຄາະ 44 ຕົວຢ່າງຄູ່ຂອງ plasma cfDNA ແລະ DNA ນ້ໍາ cerebrospinal ຈາກຄົນເຈັບ TBM, ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສຂອງການສຶກສານີ້ມີຄວາມສອດຄ່ອງສູງຂອງ 90.91% (40/44) ໃນ plasma cfDNA ແລະ DNA ນ້ໍາ cerebrospinal, ແລະຄວາມອ່ອນໄຫວແມ່ນ 95.45%. (42/44).ໃນເດັກທີ່ເປັນວັນນະໂລກ pulmonary, ຍຸດທະສາດການວິນິດໄສຂອງການສຶກສານີ້ແມ່ນມີຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ກັບຕົວຢ່າງ plasma ຫຼາຍກ່ວາຜົນການກວດພົບ Xpert ຂອງຕົວຢ່າງນ້ໍາກະເພາະອາຫານຈາກຄົນເຈັບດຽວກັນ (28.57% VS 15.38%).
ຮູບທີ 2 ການປະຕິບັດການວິເຄາະຂອງຕົວແບບວິນິດໄສວັນນະໂລກສໍາລັບຕົວຢ່າງປະຊາກອນ
Fig. 3 ຜົນການວິນິດໄສຂອງຕົວຢ່າງຄູ່
ສະຫຼຸບ: ວິທີການວິນິດໄສ hypersensitive ສໍາລັບວັນນະໂລກໄດ້ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໃນການສຶກສານີ້, ເຊິ່ງສາມາດສະຫນອງເຄື່ອງມືການວິນິດໄສທີ່ມີຄວາມອ່ອນໄຫວໃນການກວດສອບສູງສຸດສໍາລັບຄົນເຈັບທາງດ້ານການຊ່ວຍທີ່ມີວັນນະໂລກ oligobacillary (ວັດທະນະທໍາທາງລົບ).ການກວດຫາວັນນະໂລກ hypersensitive ໂດຍອີງໃສ່ plasma cfDNA ອາດຈະເປັນຕົວຢ່າງທີ່ເຫມາະສົມສໍາລັບການວິນິດໄສຂອງພະຍາດວັນນະໂລກທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວແລະໂຣກເຍື່ອຫຸ້ມສະຫມອງອັກເສບ (ຕົວຢ່າງ plasma ແມ່ນງ່າຍຕໍ່ການເກັບນ້ໍາ cerebrospinal ສໍາລັບຄົນເຈັບທີ່ສົງໃສວ່າເປັນວັນນະໂລກສະຫມອງ).
ລິ້ງຕົ້ນສະບັບ: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?ຜ່ານ%3Dihub
ແນະນຳໂດຍຫຍໍ້ກ່ຽວກັບຜະລິດຕະພັນການກວດຫາຊຸດວັນນະໂລກ Macro & Micro-Test
ໃນທັດສະນະຂອງສະຖານະການຕົວຢ່າງທີ່ສັບສົນຂອງຄົນເຈັບທີ່ເປັນວັນນະໂລກແລະຄວາມຕ້ອງການຕ່າງໆ, Macro & Micro-Test ສະຫນອງຊຸດການແກ້ໄຂ NGS ຄົບຖ້ວນສໍາລັບການສະກັດເອົາທາດແຫຼວຈາກຕົວຢ່າງ sputum, ການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດ Qualcomm ແລະລໍາດັບ, ແລະການວິເຄາະຂໍ້ມູນ.ຜະລິດຕະພັນກວມເອົາການວິນິດໄສຢ່າງໄວວາຂອງຄົນເຈັບທີ່ເປັນວັນນະໂລກ, ການກວດຫາການດື້ຢາຂອງວັນນະໂລກ, ການພິມຂອງ mycobacterium tuberculosis ແລະ NTM, ການວິນິດໄສ hypersensitivity ຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ - ລົບວັນນະໂລກແລະຄົນເປັນວັນນະໂລກ, ແລະອື່ນໆ.
ຊຸດກວດຫາເຊື້ອວັນນະໂລກ ແລະ ໄມໂຄແບັກທີເຣຍ:
| ລາຍການທີ | ຊື່ຜະລິດຕະພັນ | ເນື້ອໃນການທົດສອບຜະລິດຕະພັນ | ປະເພດຕົວຢ່າງ | ແບບທີ່ໃຊ້ໄດ້ |
| HWTS-3012 | ຕົວແທນການປ່ອຍຕົວຢ່າງ | ການນໍາໃຊ້ໃນການປິ່ນປົວ liquefaction ຂອງຕົວຢ່າງ sputum, ໄດ້ຮັບຈໍານວນການບັນທຶກຊັ້ນທໍາອິດ, Sutong ອຸປະກອນເຄື່ອງຈັກ 20230047. | ຂີ້ກະເທີ່ | |
| HWTS-NGS-P00021 | ຊຸດກວດຫາປະລິມານຂອງ Qualcomm ສໍາລັບວັນນະໂລກ hypersensitive (ວິທີການຈັບ probe) | ການກວດຫາຄວາມອ່ອນໄຫວເກີນຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ - ໂຣກປອດບວມທາງລົບ ແລະ ໜິ້ວໃນສະໝອງທີ່ບໍ່ແມ່ນການຮຸກຮານ (ການກວດຫາທາດແຫຼວ)ຕົວຢ່າງຂອງຄົນທີ່ສົງໃສວ່າຕິດເຊື້ອວັນນະໂລກ ຫຼື ໄມໂຄແບັກທີເຣຍທີ່ບໍ່ແມ່ນວັນນະໂລກແມ່ນໄດ້ຖືກວິເຄາະໂດຍການຈັດລໍາດັບ metaagenomics ທີ່ມີຄວາມເລິກສູງ, ແລະຂໍ້ມູນການກວດພົບວ່າມີວັນນະໂລກຫຼືບໍ່ເປັນວັນນະໂລກ mycobacteria ຕິດເຊື້ອ ແລະຂໍ້ມູນການດື້ຢາຫຼັກຂອງ mycobacterium tuberculosis. ໄດ້ຖືກສະຫນອງໃຫ້. | ເລືອດສ່ວນຂ້າງ, ນໍ້າລາເວດ alveolar, hydrothorax ແລະ ascites, ຕົວຢ່າງການເຈາະຈຸດສຸມ, ນ້ໍາ cerebrospinal. | ລຸ້ນທີສອງ |
| HWTS-NGS-T001 | ຊຸດກວດຫາການຕ້ານການພິມ Mycobacterium ແລະຢາ (ວິທີການຈັດລໍາດັບການຂະຫຍາຍ multiplex) | ການທົດສອບການພິມ Mycobacterium, ລວມທັງ MTBC ແລະ 187 NTMເການກວດຫາຄວາມຕ້ານທານຂອງຢາ Mycobacterium tuberculosis ກວມເອົາ 13 ຢາແລະ 16 ສະຖານທີ່ການກາຍພັນຫຼັກຂອງເຊື້ອພະຍາດຕ້ານຢາ. | Sputum, ນ້ໍາ lavage alveolar, hydrothorax ແລະ ascites, ເຈາະຕົວຢ່າງ, ນ້ໍາ cerebrospinal. | ແພລະຕະຟອມສອງລຸ້ນທີສອງ / ທີສາມ |
ຈຸດເດັ່ນ: HWTS-NGS-T001 ຊຸດກວດຫາການພິມ Mycobacterium ແລະດື້ຢາ (ວິທີການຂະຫຍາຍຫຼາຍຊ່ອງ)
ການແນະນໍາຜະລິດຕະພັນ
ຜະລິດຕະພັນດັ່ງກ່າວແມ່ນອີງໃສ່ຢາຕົ້ນຕໍແລະແຖວທີສອງທີ່ອະທິບາຍໄວ້ໃນຄໍາແນະນໍາການປິ່ນປົວ TB ຂອງ WHO, macrolides ແລະ aminoglycosides ທີ່ໃຊ້ທົ່ວໄປໃນຄໍາແນະນໍາການປິ່ນປົວ NTM, ແລະສະຖານທີ່ຕໍ່ຕ້ານຢາເສບຕິດກວມເອົາກຸ່ມຫນຶ່ງຂອງສະຖານທີ່ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານຢາໃນ. WHO Mycobacterium tuberculosis catalogue ການກາຍພັນທີ່ສັບສົນ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບພັນທຸກໍາທີ່ດື້ຢາແລະສະຖານທີ່ການກາຍພັນອື່ນໆທີ່ລາຍງານໂດຍອີງຕາມການສືບສວນແລະສະຖິຕິຂອງວັນນະຄະດີທີ່ມີຄະແນນສູງຢູ່ໃນແລະຕ່າງປະເທດ.
ການລະບຸຕົວພິມແມ່ນອີງໃສ່ສາຍພັນ NTM ທີ່ສະຫຼຸບໄວ້ໃນຂໍ້ແນະນຳ NTM ທີ່ຕີພິມໂດຍວາລະສານວັນນະໂລກ ແລະ ພະຍາດທາງເດີນຫາຍໃຈຂອງຈີນ ແລະຄວາມເຫັນດີເຫັນພ້ອມຂອງຜູ້ຊ່ຽວຊານ.ແຜ່ນຮອງພິມທີ່ອອກແບບມາສາມາດຂະຫຍາຍ, ລຳດັບ ແລະໝາຍເຫດໄດ້ຫຼາຍກວ່າ 190 ຊະນິດ NTM.
ຜ່ານເທກໂນໂລຍີການຂະຫຍາຍ multiplex PCR ເປົ້າຫມາຍ, gene genotyping ແລະ genes ທົນທານຕໍ່ຢາຂອງ Mycobacterium ໄດ້ຖືກຂະຫຍາຍໂດຍ multiplex PCR, ແລະການປະສົມ amplicon ຂອງ genes ເປົ້າຫມາຍທີ່ຈະກວດພົບແມ່ນໄດ້ຮັບ.ຜະລິດຕະພັນຂະຫຍາຍໃຫຍ່ຂື້ນສາມາດສ້າງເປັນຫ້ອງສະຫມຸດລໍາດັບຊັ້ນສູງຂອງຮຸ່ນທີສອງຫຼືຮຸ່ນທີສາມ, ແລະເວທີການລໍາດັບຮຸ່ນທີສອງແລະຮຸ່ນທີສາມທັງຫມົດສາມາດຖືກຈັດລຽງຕາມລໍາດັບຄວາມເລິກສູງເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຂໍ້ມູນລໍາດັບຂອງ genes ເປົ້າຫມາຍ.ໂດຍການປຽບທຽບກັບການກາຍພັນທີ່ຮູ້ຈັກທີ່ມີຢູ່ໃນຖານຂໍ້ມູນອ້າງອີງທີ່ສ້າງຂຶ້ນ (ລວມທັງລາຍການການກາຍພັນທີ່ສັບສົນຂອງ WHO Mycobacterium tuberculosis ແລະຄວາມສໍາພັນຂອງມັນກັບການດື້ຢາ), ການກາຍພັນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການດື້ຢາຫຼືຄວາມອ່ອນໄຫວຂອງຢາຕ້ານວັນນະໂລກໄດ້ຖືກກໍານົດ.ສົມທົບກັບການແກ້ໄຂຕົວຢ່າງການປິ່ນປົວ sputum ທີ່ເປີດດ້ວຍຕົນເອງຂອງ Macro & Micro-Test, ບັນຫາຂອງປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍອາຊິດ nucleic ຕ່ໍາຂອງຕົວຢ່າງ sputum ທາງດ້ານການຊ່ວຍ (ສິບເທົ່າຂອງວິທີການແບບດັ້ງເດີມ) ໄດ້ຖືກແກ້ໄຂ, ດັ່ງນັ້ນການຊອກຄົ້ນຫາລໍາດັບການຕໍ່ຕ້ານຢາເສບຕິດສາມາດເປັນ. ນໍາໃຊ້ໂດຍກົງກັບຕົວຢ່າງ sputum ທາງດ້ານການຊ່ວຍ.
ໄລຍະການກວດຫາຜະລິດຕະພັນ
34genes ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານຢາເສບຕິດຂອງ18ຢາຕ້ານວັນນະໂລກ ແລະ6ຢາເສບຕິດ NTM ໄດ້ຖືກກວດພົບ, ກວມເອົາ297ສະຖານທີ່ຕ້ານຢາເສບຕິດ;ສິບຊະນິດຂອງວັນນະໂລກ Mycobacterium ແລະຫຼາຍກ່ວາ190ປະເພດຂອງ NTM ຖືກກວດພົບ.
ຕາຕະລາງ 1: ຂໍ້ມູນຂອງຢາເສບຕິດ 18+6 +190+NTM
ປະໂຫຍດຂອງຜະລິດຕະພັນ
ການປັບຕົວທາງດ້ານຄລີນິກທີ່ແຂງແຮງ: ຕົວຢ່າງຂອງ sputum ສາມາດກວດພົບໄດ້ໂດຍກົງກັບຕົວແທນຂອງ liquefaction ດ້ວຍຕົນເອງໂດຍບໍ່ມີວັດທະນະທໍາ.
ການດໍາເນີນງານການທົດລອງແມ່ນງ່າຍດາຍ: ຮອບທໍາອິດຂອງການດໍາເນີນງານການຂະຫຍາຍແມ່ນງ່າຍດາຍ, ແລະການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດແມ່ນສໍາເລັດໃນ 3 ຊົ່ວໂມງ, ເຊິ່ງປັບປຸງປະສິດທິພາບການເຮັດວຽກ.
ການພິມແບບຄົບຖ້ວນແລະການຕໍ່ຕ້ານຢາ: ກວມເອົາສະຖານທີ່ພິມແລະການຕໍ່ຕ້ານຢາຂອງ MTB ແລະ NTM, ເຊິ່ງເປັນຈຸດສໍາຄັນຂອງຄວາມກັງວົນທາງດ້ານຄລີນິກ, ການພິມທີ່ຖືກຕ້ອງແລະການກວດພົບການຕໍ່ຕ້ານຢາ, ສະຫນັບສະຫນູນຊອບແວການວິເຄາະເອກະລາດ, ແລະການສ້າງບົດລາຍງານການວິເຄາະດ້ວຍການຄລິກດຽວ.
ຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້: ຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງຜະລິດຕະພັນ, ການປັບຕົວເຂົ້າກັບແພລະຕະຟອມ ILM ແລະ MGI/ONT.
ສະເພາະຜະລິດຕະພັນ
| ລະຫັດຜະລິດຕະພັນ | ຊື່ຜະລິດຕະພັນ | ເວທີການຊອກຄົ້ນຫາ | ຂໍ້ມູນສະເພາະ |
| HWTS-NGS-T001 | ຊຸດກວດຫາການຕ້ານການພິມ Mycobacterium ແລະຢາ (ວິທີການຂະຫຍາຍ multiplex) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
ເວລາປະກາດ: 23-01-2024