ການແບ່ງປັນວັນນະຄະດີ: ການວິເຄາະໄວຣັດຂອງສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມຂະໜາດນ້ອຍໃນອາຟຣິກາຕາເວັນຕົກເປີດເຜີຍໄວຣັດຊະນິດໃໝ່ ແລະ ຄວາມສ່ຽງຈາກສັດສູ່ຄົນ

ການສຶກສາຄົ້ນຄວ້າຫຼ້າສຸດທີ່ເຜີຍແຜ່ໃນຈຸລິນຊີໄດ້ດຳເນີນການວິເຄາະ metagenomic ຂອງໄວຣັດໃນສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມຂະໜາດນ້ອຍປ່າ 846 ໂຕ — ລວມທັງຄ້າງຄາວ, ໜູ ແລະ ກະຮອກ — ທີ່ເກັບມາຈາກ Sierra Leone, ອາຟຣິກາຕາເວັນຕົກ. ການສຶກສາໄດ້ລະບຸໄວຣັດ RNA ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມທັງໝົດ 39 ຊະນິດ, ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍໄວຣັດໃໝ່ 26 ຊະນິດ ແລະ ໄວຣັດທີ່ຮູ້ຈັກກ່ອນໜ້ານີ້ 13 ຊະນິດ. ໃນນັ້ນ, ຄອບຄົວ Paramyxoviridae ມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍສູງສຸດ, ໃນຂະນະທີ່ໜູມີຈຳນວນຊະນິດໄວຣັດຫຼາຍທີ່ສຸດ (n = 26).

ການປະເມີນຄວາມສ່ຽງຕໍ່ສັດ ແລະ ເຊື້ອໄວຣັດໄດ້ເປີດເຜີຍໄວຣັດທີ່ຕິດຕໍ່ຈາກສັດ ແລະ ເຊື້ອໄວຣັດທີ່ຮູ້ຈັກສາມຊະນິດຄື: ໄວຣັດອັກເສບສະໝອງ, ໄວຣັດ Lassa, ແລະ ໄວຣັດ Rocahepevirus sp., ພ້ອມທັງໄວຣັດສາມຊະນິດທີ່ມີຄວາມສ່ຽງຕໍ່ການແຜ່ກະຈາຍຂອງເຊື້ອໄວຣັດຄື: ໄວຣັດ Melian, ໄວຣັດຕັບອັກເສບຈາກໜູ, ແລະ ໄວຣັດ Hunnivirus A. ໂດຍສະເພາະ, ໃນບັນດາໄວຣັດທີ່ຖືກລະບຸໃໝ່, ໄວຣັດ Bat ledantevirus 2 ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມສຳພັນທາງ phylogenetic ທີ່ໃກ້ຄຽງທີ່ສຸດກັບໄວຣັດ Le Dantec ທີ່ຕິດເຊື້ອໃນມະນຸດ. ການວິເຄາະເຊີຣໍໂລຊີຍັງໄດ້ກວດພົບພູມຕ້ານທານທີ່ເປັນກາງຕໍ່ໄວຣັດນີ້ໃນ 2.8% ຂອງຊາວບ້ານທ້ອງຖິ່ນ, ເຊິ່ງຊີ້ບອກເຖິງການສຳຜັດກັບມະນຸດກ່ອນໜ້ານີ້, ເຊິ່ງອາດຈະບໍ່ຖືກກວດພົບ.

ການຄົ້ນພົບເຫຼົ່ານີ້ເນັ້ນໃຫ້ເຫັນເຖິງການມີຢູ່ຂອງແຫຼ່ງສະສົມໄວຣັສທີ່ສຳຄັນໂດຍໜູໃນອາຟຣິກາຕາເວັນຕົກ ແລະ ເນັ້ນໜັກເຖິງຄວາມສຳຄັນທີ່ສຳຄັນຂອງຍຸດທະສາດການເຝົ້າລະວັງແບບປະສົມປະສານໃນການໂຕ້ຕອບລະຫວ່າງຄົນກັບສັດ. ການລວມເອົາການກວດຫາເຊື້ອພະຍາດທາງພັນທຸກຳກັບການຢັ້ງຢືນທາງເຊລວິທະຍາສະໜອງຂອບການເຮັດວຽກທີ່ເຂັ້ມແຂງສຳລັບການກຳນົດໄວຣັສທີ່ມີທ່າແຮງທີ່ຈະແຜ່ລະບາດຈາກສັດສູ່ຄົນ ແລະ ການແຜ່ລາມ.

ໃນໄລຍະທົດສະວັດທີ່ຜ່ານມາ, ຫຼາຍກວ່າ 60% ຂອງພະຍາດຕິດຕໍ່ທີ່ເກີດຂຶ້ນໃໝ່ໃນມະນຸດມີຕົ້ນກຳເນີດມາຈາກແຫຼ່ງລ້ຽງສັດ, ໂດຍມີຄ້າງຄາວ, ໜູ, ແລະ ໜູປ່າ ທີ່ຖືກຮັບຮູ້ວ່າເປັນເຈົ້າພາບຫຼັກຂອງໄວຣັສທີ່ຕິດຕໍ່ຈາກສັດສູ່ຄົນ. ອາຟຣິກາຖືກຖືວ່າເປັນຈຸດຮ້ອນສຳລັບພະຍາດທີ່ຕິດຕໍ່ຈາກສັດສູ່ຄົນ. ຕົວຢ່າງ, Sierra Leone ໄດ້ລາຍງານກໍລະນີຫຼາຍກວ່າ 28,000 ກໍລະນີໃນລະຫວ່າງການລະບາດຂອງພະຍາດອີໂບລາໃນປີ 2014–2016.

ເຖິງວ່າຈະມີພາລະອັນສຳຄັນຂອງພະຍາດຕິດຕໍ່ຈາກສັດສູ່ຄົນໃນພາກພື້ນນີ້, ແຕ່ຄວາມຫຼາກຫຼາຍ ແລະ ການແຈກຢາຍຂອງໄວຣັດໃນສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມຂະໜາດນ້ອຍໃນທຳມະຊາດຍັງບໍ່ທັນໄດ້ລະບຸລັກສະນະຢ່າງພຽງພໍ. ເພື່ອແກ້ໄຂຊ່ອງຫວ່າງນີ້, ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ດຳເນີນການວິເຄາະໄວຣັດຢ່າງເປັນລະບົບຂອງສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມຂະໜາດນ້ອຍໃນທຳມະຊາດ 846 ໂຕທີ່ຖືກຈັບໄດ້ໃນສາມສະຖານທີ່ໃນ Sierra Leone ລະຫວ່າງປີ 2018 ແລະ 2023. ການສຶກສາດັ່ງກ່າວມີຈຸດປະສົງເພື່ອລະບຸລັກສະນະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງໄວຣັດ, ກຳນົດຜູ້ສະໝັກທີ່ມີທ່າແຮງການສົ່ງຕໍ່ຂ້າມຊະນິດພັນ, ປະເມີນຄວາມສ່ຽງຈາກສັດສູ່ຄົນ, ແລະ ສ້າງຫຼັກຖານເພື່ອສະໜັບສະໜູນລະບົບເຕືອນໄພລ່ວງໜ້າສຳລັບພະຍາດຕິດຕໍ່ທີ່ເກີດຂຶ້ນໃໝ່.

ວິທີການຫຼັກ

ການສຶກສາໄດ້ນຳໃຊ້ຂະບວນການເຮັດວຽກກ່ຽວກັບ metagenomics ຂອງໄວຣັດທີ່ສົມບູນແບບ:

• ການປະມວນຜົນຕົວຢ່າງ:ເນື້ອເຍື່ອຫົວໃຈ, ຕັບ, ມ້າມ, ປອດ, ແລະ ໝາກໄຂ່ຫຼັງໄດ້ຖືກເກັບກຳ, ລວມເຂົ້າກັນ, ເຮັດໃຫ້ເປັນເອກະພາບ, ແລະ ໄດ້ຮັບການສະກັດເອົາ RNA ທັງໝົດ.
• ການຈັດລຳດັບ ແລະ ການປະກອບ:ການຫຼຸດຜ່ອນ RNA ຂອງ Ribosomal ໄດ້ຖືກປະຕິບັດກ່ອນການສ້າງຫ້ອງສະໝຸດ, ຕາມດ້ວຍການຈັດລຳດັບຜົນຜະລິດສູງໂດຍໃຊ້ແພລດຟອມ Illumina NovaSeq 6000. ສ່ວນປະກອບຂອງໄວຣັດໄດ້ຖືກປະກອບຂຶ້ນໃໝ່.
• ການລະບຸໄວຣັສ:ໄວຣັສໄດ້ຖືກລະບຸໂດຍອີງໃສ່ການຈັດລຽງຂອງເຊື້ອ RNA polymerase (RdRp) ທີ່ຂຶ້ນກັບ RNA. ມີພຽງແຕ່ໄວຣັສທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບສັດກະດູກສັນຫຼັງເທົ່ານັ້ນທີ່ຍັງຄົງຢູ່, ຍົກເວັ້ນໄວຣັສເຊື້ອແບັກທີເຣຍ, ເຊື້ອລາ ແລະ ໄວຣັສພືດ.
• ການວິເຄາະຊີວະຂໍ້ມູນຂ່າວສານ:ການສ້າງໂຄງສ້າງທາງພັນທຸກໍາຄືນໃໝ່, ການວິເຄາະການລວມຕົວກັນ, ການສ້າງແບບຈໍາລອງເຄືອຂ່າຍການສົ່ງຕໍ່ຂ້າມຊະນິດພັນ, ແລະ ການປະເມີນຄວາມສ່ຽງຈາກສັດສູ່ຄົນໄດ້ຖືກດໍາເນີນ.
• ການຢັ້ງຢືນທາງເຊລໂລຊີ:ການທົດສອບການເປັນກາງຂອງເຊື້ອໄວຣັສ pseudovirus ທີ່ອີງໃສ່ VSV ໄດ້ຖືກພັດທະນາຂຶ້ນສຳລັບ Bat ledantevirus 2. ພູມຕ້ານທານທີ່ເປັນກາງໄດ້ຖືກກວດພົບໃນ 2.8% ຂອງເລືອດຂອງມະນຸດ, ເຊິ່ງເປັນຫຼັກຖານຂອງການຕິດເຊື້ອຈາກສັດໄປຫາສັດທີ່ມີທ່າແຮງ.
  

  ສຶກສາຜົນໄດ້ຮັບ

  1. ການຄົ້ນພົບ ແລະ ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງໄວຣັດ

  ການສຶກສານີ້ໄດ້ດຳເນີນການວິເຄາະລຳດັບ transcriptomic ໃນສັດປ່າ 846 ຊະນິດທີ່ເກັບມາຈາກ Sierra Leone, ລວມທັງໜູ, ຄ້າງຄາວ ແລະ ກະຮອກ. ອີງຕາມລຳດັບ gene ຂອງ RNA polymerase (RdRp) ທີ່ຂຶ້ນກັບ RNA ທີ່ສົມບູນ, ໄດ້ລະບຸໄວຣັສ RNA ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມທັງໝົດ 39 ຊະນິດ, ປະກອບດ້ວຍໄວຣັສທີ່ຮູ້ຈັກກ່ອນໜ້ານີ້ 13 ຊະນິດ ແລະ ໄວຣັສໃໝ່ 26 ຊະນິດ.

  ໃນດ້ານອົງປະກອບຂອງໄວຣັດ, ຄອບຄົວ Paramyxoviridae ສະແດງໃຫ້ເຫັນລະດັບຄວາມຫຼາກຫຼາຍສູງສຸດໃນທຸກໆສາມລຳດັບຂອງໂຮດ, ຕິດຕາມມາດ້ວຍ Astroviridae ແລະ Picornaviridae. ກ່ຽວກັບການແຈກຢາຍໂຮດ, ໜູໄດ້ປະກອບສ່ວນໃຫ້ມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງໄວຣັດຫຼາຍທີ່ສຸດ, ເປັນບ່ອນຢູ່ອາໄສຂອງໄວຣັດທັງໝົດ 26 ຊະນິດ, ເຊິ່ງຊີ້ບອກເຖິງບົດບາດທີ່ໂດດເດັ່ນຂອງພວກມັນໃນຖານະເປັນແຫຼ່ງສະສົມຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງໄວຣັດໃນພາກພື້ນ.

  2. ຄວາມສ່ຽງຈາກສັດສູ່ຄົນ

  ການປະເມີນຄວາມສ່ຽງຈາກສັດສູ່ຄົນໄດ້ລະບຸໄວຣັສຈາກສັດສູ່ຄົນທີ່ຮູ້ຈັກສາມຊະນິດຄື: ໄວຣັສ encephalomyocarditis, ໄວຣັສ Lassa, ແລະ ໄວຣັສ Rocahepe. ນອກຈາກນັ້ນ, ໄວຣັສສາມຊະນິດຄື: ໄວຣັສ Melian, ໄວຣັສຕັບອັກເສບໜູ, ແລະ ໄວຣັສ Hunnivirus A ໄດ້ຖືກກໍານົດວ່າມີຄວາມສ່ຽງຕໍ່ການແຜ່ລາມ.

  ໃນບັນດາໄວຣັສທີ່ຄົ້ນພົບໃໝ່ 26 ຊະນິດ, ຄາດຄະເນວ່າມີ 4 ຊະນິດທີ່ມີທ່າແຮງທີ່ຈະຕິດຕໍ່ຈາກສັດສູ່ຄົນສູງໂດຍອີງໃສ່ລັກສະນະທາງພັນທຸກໍາ ແລະ ຈີໂນມ. ສິ່ງທີ່ໜ້າສັງເກດແມ່ນ, ໄວຣັສ Bat ledante 2 ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມສຳພັນທາງພັນທຸກໍາທີ່ໃກ້ຄຽງທີ່ສຸດກັບໄວຣັສ Le Dantec ທີ່ຕິດເຊື້ອໃນມະນຸດທີ່ຮູ້ຈັກ.

  ການສືບສວນເຊີຣໍໂລຊີຕໍ່ມາໄດ້ສະໜັບສະໜູນການຄົ້ນພົບນີ້ຕື່ມອີກ, ຍ້ອນວ່າພູມຕ້ານທານທີ່ເປັນກາງຕໍ່ກັບໄວຣັດ Bat ledantevirus 2 ໄດ້ຖືກກວດພົບໃນ 2.8% ຂອງເຊຣົວຈາກຊາວບ້ານທ້ອງຖິ່ນ. ຜົນໄດ້ຮັບນີ້ຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າການຕິດເຊື້ອທີ່ບໍ່ຮູ້ຈັກ ຫຼື ບໍ່ມີອາການອາດຈະເກີດຂຶ້ນແລ້ວພາຍໃນປະຊາກອນມະນຸດ, ເຊິ່ງເນັ້ນໃຫ້ເຫັນເຖິງເສັ້ນທາງການແຜ່ລະບາດຈາກສັດທີ່ມີທ່າແຮງແຕ່ບໍ່ເຄີຍກວດພົບມາກ່ອນ.

  3. ການເຄື່ອນໄຫວການສົ່ງຕໍ່ຂ້າມຊະນິດ

  ການວິເຄາະການແຜ່ເຊື້ອຂ້າມຊະນິດພັນໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າໜູຢູ່ໃນຕຳແໜ່ງສູນກາງພາຍໃນເຄືອຂ່າຍການແບ່ງປັນໄວຣັດ, ເຮັດໜ້າທີ່ເປັນຈຸດສຳຄັນທີ່ອຳນວຍຄວາມສະດວກໃນການແລກປ່ຽນໄວຣັດລະຫວ່າງຊະນິດພັນເຈົ້າພາບ. ມີການລະບຸວ່າມີໄວຣັດທັງໝົດ 15 ຊະນິດທີ່ມີທ່າແຮງສຳລັບການແຜ່ເຊື້ອຂ້າມຊະນິດພັນ.

  ການວິເຄາະເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບຮູບແບບການສົ່ງຕໍ່ຂ້າມລຳດັບຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າການແບ່ງປັນໄວຣັດເກີດຂຶ້ນເລື້ອຍໆໃນບັນດາເຈົ້າພາບພາຍໃນລຳດັບການຈັດປະເພດດຽວກັນ, ເຊິ່ງຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າຄວາມສຳພັນຂອງເຈົ້າພາບມີບົດບາດສຳຄັນໃນການເຄື່ອນໄຫວການສົ່ງຕໍ່. ໃນທາງກົງກັນຂ້າມ, ຄ້າງຄາວສະແດງໃຫ້ເຫັນຄວາມສາມາດໃນການສົ່ງຕໍ່ຂ້າມລຳດັບທີ່ຕ່ຳກວ່າ.

  ສິ່ງສຳຄັນ, ຫຼັກຖານຂອງການຂະຫຍາຍຕົວຂອງພື້ນທີ່ຂອງໂຮສຕ໌ໄດ້ຖືກສັງເກດເຫັນໃນໄວຣັສບາງຊະນິດ. ຕົວຢ່າງ, ໄວຣັສ Melian, ເຊິ່ງກ່ອນໜ້ານີ້ຖືກພິຈາລະນາວ່າເປັນສະເພາະກັບໜູ, ຍັງຖືກກວດພົບໃນໜູໃນການສຶກສານີ້, ເຊິ່ງຊີ້ບອກເຖິງການປ່ຽນແປງທີ່ອາດເກີດຂຶ້ນໃນການປັບຕົວຂອງໂຮສຕ໌ ແລະ ຄວາມສ່ຽງທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນຂອງການຕິດຕໍ່ທີ່ກວ້າງຂວາງ.

  

  ສະຫຼຸບ ແລະ ຜົນສະທ້ອນຕໍ່ສຸຂະພາບສາທາລະນະ

  • ຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງໄວຣັດສູງໃນສັດລ້ຽງລູກດ້ວຍນົມຂະໜາດນ້ອຍໃນທຳມະຊາດ:ການຄົ້ນພົບໄວຣັສ RNA 39 ຊະນິດ, ລວມທັງຊະນິດໃໝ່ 26 ຊະນິດ, ເປີດເຜີຍໃຫ້ເຫັນເຖິງແຫຼ່ງໄວຣັສຂະໜາດໃຫຍ່ໃນພາກພື້ນ ແລະ ລາຍງານເປັນຄັ້ງທຳອິດວ່າມີໄວຣັສໃໝ່ທີ່ມີທ່າແຮງສູງຕໍ່ສັດ (ຕົວຢ່າງ, Bat ledantevirus 2).
  • ໜູເປັນເປົ້າໝາຍການເຝົ້າລະວັງທີ່ມີບູລິມະສິດ:ໜູເຮັດໜ້າທີ່ເປັນສູນກາງສຳຄັນສຳລັບການແຜ່ລະບາດຂອງໄວຣັດ ແລະ ມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງໄວຣັດສູງສຸດ, ເຊິ່ງເປັນຕົວແທນຂອງຄວາມສ່ຽງຕໍ່ການແຜ່ລະບາດທີ່ໃຫຍ່ທີ່ສຸດ.
  • ຄວາມຕ້ອງການຍຸດທະສາດການເຝົ້າລະວັງແບບປະສົມປະສານ:ການຄົ້ນພົບສະໜັບສະໜູນການຈັດລຳດັບຄວາມສຳຄັນຂອງໜູໃນໂຄງການເຝົ້າລະວັງຢ່າງຫ້າວຫັນ ແລະ ການປະຕິບັດວິທີການປະສົມປະສານທີ່ລວມເອົາການວິເຄາະ metagenomics, serology, ແລະ ການຕິດຕາມກວດກາທາງດ້ານນິເວດວິທະຍາຢູ່ໃນໜ້າຕິດຕໍ່ລະຫວ່າງມະນຸດກັບສັດປ່າ.

  ໂດຍລວມແລ້ວ, ການສຶກສານີ້ສະໜອງຫຼັກຖານທີ່ສຳຄັນເພື່ອສະໜັບສະໜູນລະບົບເຕືອນໄພລ່ວງໜ້າ ແລະ ຂອບການປະເມີນຄວາມສ່ຽງສຳລັບພະຍາດຕິດຕໍ່ຈາກສັດທີ່ເກີດຂຶ້ນໃໝ່, ເຊິ່ງເນັ້ນໜັກເຖິງຄວາມສຳຄັນຂອງການເຝົ້າລະວັງຢ່າງຕັ້ງໜ້າໃນພາກພື້ນທີ່ມີຄວາມສ່ຽງສູງ.

  ຂໍ້ມູນຜະລິດຕະພັນ